Direcţia generală a Fondului arhivistic guvernamental
Direcția restaurare a documentelor
Direcția documente cinematografice și audiovizuale
Direcția digitalizare și e-Arhiva
Direcţia monitorizare și evaluare a Fondului arhivistic
Direcția Fondului arhivistic social-politic
- Secția completare a Fondului arhivistic social-politic
- Secția evidență și păstrare a documentelor
Direcția management instituțional
- Secţia financiară şi evidenţă contabilă
- Serviciul logistic
- Serviciul resurse umane
Serviciul protecția secretului de stat
Serviciul relații internaționale